ist doch alles absolut im grünen Bereich.

Der blockierte Anschluß ist Kontakt 9. Der Anschluß daneben ist 10 und sollte frei bleiben. Auf dem Board ist bei 9 kein Kontakt.
Nun schraubst du einen USB-Stecker vom Slotblech ab, und benutzt ihn für deinen internen Hub. Mit dem Anschluß sollte es dann keine Probleme bei der Funktion geben.
Im Slotblech fehlt dann der 2. Anschluß. Du kannst dann überlegen, ob du es nutzt. Es könnte sein, daß das Kabel zu kurz ist. Eventuell USB1 und USB3 tauschen. Das kannst du am besten sehen...